Hidan hat sein Ritual vollendet und Asuma den Gnadenstoß verpasst. Als Kakuzu auch seine Gegner loswerden wollte kamen ihm Aboa und Raido dazwischen, die ihn und Hidan ablenkten sodass Asuma's Team von Ino und Choji in Sicherheit gebracht werden kann. Hidan und Kakuzu wollen sich dies anfangs nicht gefallen lassen doch bekommen sie telepatisch einen Befehl von Pain sich vorerst zurück zu ziehen da sie mit Extrahierung der bisher gesammelten Bijuus beginnen wollen. Wenn auch nicht begeistert davon ziehen sich die 2 von Akatsuki zurück. Derweil verabschiedet sich Asuma noch einmal von jedem und erzählt Shikamaru wer im normalen Leben der König in Shougi wäre. Nach seinen letzten Worten stirbt Asuma und es beginnt zu regnen.
Nach Asumas Attacke erleidet nicht nur Hidan Verbrennungen, sondern auch Asuma selbst. Auch als Hidan sich selbst verletzt, nimmt Asuma Schaden. Shikamaru versucht Hidan mit Kage Mane no Jutsu aufzuhalten und überlegt, was passiert ist und wie man Hidan aufhalten kann. Nachdem er herausgefunden hat, was los ist, zwingt er Hidan aus seinem Kreis zu gehen, womit dessen "Fluch" über Asuma unterbrochen ist. Asuma nutzt die Chance und köpft Hidan.
Obwohl Asuma Hidan den Kopf abgeschlagen hat, lebt dieser immer noch. Kakuzu mischt sich nun kurz ein und näht Hidans Kopf wieder an dessen Körper. Hidan will, dass sich keiner mehr einmischt, weshalb Kakuzu sich um die anderen kümmern will und gegen Kotetsu und Izumo kämpft, die jedoch unterliegen. Derweil will sich Hidan an Asuma rächen - doch dieser kann immer noch kämpfen und schafft es, bei einem weiteren Versuch von Hidan Asuma mit der Sense zu erwischen, ihn auszutricksen, sodass Hidans eigene Sense ihn selbst erwischt. Doch sah Asuma nicht, dass Hidan dabei wieder in seinem Kreis stand. Somit wird Asuma erneut verletzt. Shikamaru versucht Asuma noch zu helfen, doch scheint alles zu spät, da Hidan darauf mit seinem Speer durch sein Herz sticht.
Hidan und Kakuzu sind endlich bei dem Kopfgeldeintreiber Zangei angekommen. Nach kurzer Zeit aber ist es Hidan zu widerlich in der Toilette (Unterschlupf von Zangei) und er geht raus an die frische Luft. Währenddessen trainiert Naruto die nächste Stufe des Rasengan. Kakashi zeigt Naruto, dass er ebenfalls das Rasengan beherrscht, aber Naruto meint nur, er wolle damit angeben. Aber Kakashi sagt Naruto, er sei der einzige Shinobi, dem er zutrauen würde, den 4.Hokage zu übertreffen. Dadurch ist Naruto sehr angespornt und will dieses neue Rasengan erlernen. Während des Trainings verwandelt sich Naruto in die 3-schwänzige Form des Kyuubi, aber Yamato kann Schlimmeres verhindern. Unterdessen sind mehrere Teams auf dem Weg, Akatsuki zu finden. Hidan sitzt auf einer Treppe vor dem Toilettenhaus und wartet auf Kakuzu, bis jemand hinter ihm auftaucht.
Die Konoha-Ninjas haben einige mögliche Verstecke von Akatsuki gefunden, jedoch keine Mitglieder der Organisation, weshalb sich die meisten Teams beim jeweiligen Ort verstecken und abwarten, ob jemand kommt. Derweil ist jemand hinter Hidan erschienen: es ist Asuma, der ihn mit seinem Team angreift. Doch stellen sie entsetzt fest, dass Hidan nicht getötet werden kann. Kakuzu taucht auch auf, doch will Hidan diesen Kampf allein austragen. Asuma und Shikamaru geben ihr bestes, doch nichts will wirklich gegen Hidan klappen. Dieser schafft es im Gegenzug sogar, Asuma an der Wange mit seiner Sense einen Kratzer zu verpassen. Asuma will dann Nin-Jutsu einsetzen und setzt eine Aschewolke gegen Hidan ein, die Sekunden später sich entzündet. Zuletzt sieht man nur noch, wie Hidan das an seiner Sense klebende Blut ableckt, sich in einen von ihm auf den Boden gemalten rituellen Kreis stellt, und sich seltsam skelett-artig verwandelt...
Tsunade hat noch keine Nachricht von den Teams erhalten, die nach Hidan und Kakuzu Ausschau halten sollten, was diese verärgert. Asuma hat währenddessen den zerstörten Feuertempel erreicht, um weitere Informationen zu bekommen. Die überlebenden Mönche beten für Asuma und sein Team, dass sie diese Mission heil überleben. Asuma erinnert sich dabei an seine Vergangenheit, als er immer zusammen mit Chiriku trainiert hatte. Asuma macht sich danach mit seinem Team auf, die Mörder seines besten Freundes zu finden. Inzwischen wird Naruto von Yamato und Kakashi zu einer Portion Ramen eingeladen (auch wenn es einige Schwierigkeiten gab). Kakashi zeigt dem gestärkten Naruto danach ein Geheimnis, und zwar, dass auch er das Rasengan beherrscht.
Naruto trainiert immer weiter mit dem Jutsu der tausend Schattendoppelgänger, wobei er nicht bemerkt, dass Yamato sehr erschöpft ist. Sakura möchte Naruto so gut wie möglich unterstützen und stellt spezielle Pillen her, die Naruto aber überhaupt nicht schmecken. Währendessen gehen Hidan und Kakuzu weiter, um das Kopfgeld für Chiriku abzuholen, wobei Kakuzu abermals damit droht, dass er Hidan irgendwann einmal umbringen wird. Endlich schafft es auch Naruto, den Wasserfall zu teilen und Kakashi sagt, dass sie nun mit der Entwicklung eines neuen Jutsus beginnen könnten.
Naruto nimmt sein Training wieder auf und schafft es nun, mit seinem Chakra ein Blatt zu zerschneiden. Nun folgt der nächste Schritt: er muss das Wasser vom Wasserfall, den Yamato erschaffen hat, mithilfe seines Chakras aufhalten. Währenddessen machen sich Kakuzu und Hidan auf zum Feuertempel, um ihre Finanzen aufzubessern und um einen möglichen Jinchuuriki (evtl. Sora) zu finden. Naruto hat inzwischen einige Probleme und schafft es noch nicht ganz, das Wasser zu spalten. Derweil erreichen Hidan und Kakuzu den Feuertempel, wo sie auf Chiriku treffen. Kakuzu will dessen Kopfgeld kassieren, weshalb es zu seinem Kampf kommt. Doch weiß Chiriku sich zu wehren und kann die beiden in Bedrängnis bringen, weshalb Hidan wieder auf seine spezielle Technik zurückgreifen muss. Als sie dann Chiriku getötet haben, wollen sie sich nun aufmachen, das Kopfgeld zu kassieren. Einer der Mönche hatte den Angriff überlebt und wollte sofort Konoha informieren. In der Zwischenzeit hatte Naruto noch keine Fortschritte gemacht und fragt Kakashi nach einem Tipp, doch dieser sagt nur, dass er sich ruhig Zeit lassen könne, da es normalerweise Jahre braucht, sein Element zu kontrollieren, und bei Sasuke es nur eine Ausnahme war, da dieser ein Genie ist. Als Naruto das hörte, wollte er umso schneller diese Etappe schaffen, weshalb Yamato den Platz vergrößerte, damit Naruto mit 1000 Doppelgängern weiter machen kann.
Asuma schwelgt in Erinnerungen am Grab seines Vaters, dem 3. Hokage. Währenddessen ist Tsunade mal wieder sauer über die Ältesten, da diese sie für den Angriff von Furiido verantwortlich machen, doch erfährt Tsunade auch, das Kakashi und Jiraiya zurück sind. Kakashi klärt Tsunade auf, dass einige Leute in schwarzen Mänteln in Zweier-Gruppen in verschiedenen Ländern gesehen wurden und anscheinend näher kommen. Tsunade kann sich denken, dass sie es wohl bald mit Akatsuki zu tun bekommen. Inzwischen will Yugito Nii, die der Jinchuuriki der 2-schwänzigen Katze ist, ihre Angreifer von Akatsuki töten, und deshalb verwandelt sie sich in ihr Bijuu, was sie wohl komplett zu kontrollieren scheint. Zur selben Zeit kommt Kakashi im Krankenhaus vorbei, wo Sai und Naruto liegen. Naruto will wieder mit seinem Training weiter machen, worauf Kakashi ihm erstmal erzählt, er solle es nicht übertreiben, da er sonst bald wieder im Krankenhaus endet. Asuma kommt auch noch kurz vorbei, beginnt eine kleine Unterhaltung mit Kakashi, die aber von Kurenai unterbrochen wird. Derweil, am Abend in Kumogakure, hängt, an den Händen gepfählt, Yugito bewusstlos an einer Wand, da Hidan und Kakuzu sie besiegt haben. Kakuzu erzählt Hidan von ihrem nächsten Ziel: dem Feuer-Reich.
Naruto ist wieder er selbst und versucht nun auch bei Sora sein Glück. Er wird immer wieder zurückgestoßen, gibt aber nicht auf, ihn zu retten. Sakura will Naruto helfen, doch dieser will es alleine schaffen. Asuma und Furiido alias Kazuma kämpfen weiterhin im Wald. Sai kommt Asuma zur Hilfe. Nach einiger Zeit, gelingt es Asuma, Furiido zu überwältigen. Inzwischen schafft es auch Naruto zu Sora durchzudringen und er verwandelt sich langsam wieder zurück. Allerdings verträgt Sora das Kyuubi-Chakra nicht so gut wie Naruto und ist schwer verletzt. Naruto & Co. machen ihm aber am Ende klar, dass er nun Freunde gefunden hat. Am nächsten Tag verabschiedete sich Sora, der nun die Welt bereisen und neue Freunde finden will. Mittlerweile spielen Asuma und Shikamaru wieder Shougi, während sie sich über den wahren König unterhalten. In Kumogakure läuft währenddessen eine Kunoichi namens Yugito in einigen Tunneln herum und scheint verfolgt zu werden. Ihr kommen zwei Männer von Akatsuki namens Hidan und Kakuzu entgegenm, die ihr Bijuu, die 2-schwänzige Katze, haben wollen.
Nachdem Sora seinen dritten Schwanz entwickelt, scheint er komplett die Kontrolle über sich zu verlieren. Naruto versucht weiterhin zu Sora vorzudringen und ihn zu beruhigen, was aber fehl schlägt. Auch Shikamaru, Ino und Choji versuchen sora still zu stellen, allerdings misslingt dies ebenfalls. Noch immer kämpft Asuma gegen Furiido. Derweil versucht Naruto erneut, zu Sora vorzudringen, hält ihn fest und redet mit ihm. Doch der direkte Kontakt mit Sora bewirkt, dass auch sich Narutos Kyuubi-Chakra sich aktiviert und er in die 1-schwänzige Form wechselt, was Furiido sehr amüsant findet. Yamato versucht vergeblich Narutos Chakra zu unterdrücken. Naruto bekommt ebenfalls seinen drittenten Schwanz. Sora greift Naruto an, der versucht, sich unter Kontrolle zu halten und nur auszuweicht. Die Situation verschlechtert sich allerdings, als beide in die 4-schwänzige form gehen. Naruto schafft es nach einiger Zeit schließlich, sich wieder zurückzuverwandeln, indem er sich selbst verletzt. Der Versuch, zu Sora vorzudringen, geht weiter.
Konoha wurde von der Barriere und den Zombies befreit. Allerdings sind 3 der 4 wiederbelebten Elitewächtern dabei, ihren Riesenblitz zu beschwören. Derweil prügelt Furiido auf Sora ein und versucht die Kraft in Sora zu erwecken, was ihm schließlich auch gelingt. Naruto kämpft noch immer gegen Fuuka, findet aber nach einer Weile ihr Geheimiss heraus, besiegt sie und macht sich auf zu Sora. Inzwischen erfährt Sora von Furiido, dass er ein Pseudo-Jinchuuriki. Währenddessen befreite sich Asuma und besiegt Kitane, um auch nach Sora zu suchen. Da die anderen 3 Elitewächter nun nutzlos für Furiido sind, löste er das Jutsu, was sie am Leben hällt, auf. Danach läst er das Siegel von Sora auf, der nun seine ganze Kraft freisetzt.
Naruto und Asuma kommen zu Sora und Furiido. Sora kann sein rotes Chakra nicht kontrollieren und geht in die 0-schwänzgie Form. Asuma und Furiido fangen eine Unterhaltung an, während Sora sich weiterhin unter Schmerzen verwandelt. Naruto entwickelt einen unglaublichen Hass auf Furiido, weil Sora wegen ihm genauso wie Naruto leiden muss. Inzwischen steht Sora wieder auf gelangt aber kurze Zeit darauf in die 1-schwänzige Form. Sora entschließt sich dazu, sich dem Chakra hinzugeben und nicht nur das Dorf, sondern die ganze Welt zu zerstören. Als er Naruto angreift, mischt sich Asuma ein und stößt Naruto weg. Die beiden werden schließlich von Yamato gerettet. Yamato und Sakura helfen mit, Sora zu beruhigen, während Asuma versucht, Furiido zu beschäftigen. Mittlerweile stellt sich heraus, dass Furiido Kazuma ist. Nachdem Sora Sakura angegriffen hat, beginnen er und Naruto ein Gespräch, doch Sora lässt nicht auf sich einreden und will erneut angreifen. Shikamaru, Choji und Ino kommen zur Hilfe. Naruto und Sora unterhalten sich weiter, dennoch gerät Sora in die 3-schwänzige Form.
Während Konoha weiterhin von Zombies angegriffen wird, erklärt Furiido Sora seinen Plan. Derweil hat Naruto Probleme mit Fuuka, Yamato muss sich erneut Fudou stellen, Sakura ist inzwischen von Fuen in einen Felsen eingesperrt worden und Asuma kämpft gegen Kitane. Derweil greift sora Furiido an, da er nicht wollte, dass ganz Konoha ausradiert wird. Sakura ist währenddessen dabei, sich von dem Gen-Jutsu zu befreien und besiegt Fuen. Somit wird auch die Barriere, die um Konoha erreichtet worden ist, aufgelöst. Shikamaru gesellt sich zu den restlichen Konoha-Shinobi, um seine Angriffstaktik zu erklären, wie sie gegen die Zombies angehen. Naruto kämpft immernoch und wird schließlich unter Schlamm begraben. Zur selben Zeit schafft es Yamato, Fudou für immer zu beseitigen, womit sich die Zombies in Staub auflösen.
Choji, Ino, Kiba und Rock Lee unterstützen die Shinobi am Haupttor, sich vor den Untoten zu verteidigen. Währenddessen erreicht Asuma die Stromversorgung von Konoha und findet die 4 Särge der zwölf Elitewächter, die sich nun öffnen. Inzwischen schnappt sich Naruto Sora. Dieser entkommt allerdings. Naruto will ihm folgen, wird aber von Fuuka aufgehalten, die ihn erneut zu einem Kampf auffordert. In der Zwischenzeit sind Asumas 4 Freunde wieder am Leben und müssen dem, der sie wiederbelebt hat, gehorchen. es kommt zum Kampf zwischen Asuma und seinem alten Freund Kitane. Sakura und Yamato stoßen dazu und wollen Asuma helfen. Asuma erkennt den Plan der Feinde und befiehlt Sakura und Yamato, die anderen seiner alten Freunde zu verfolgen. Derweil kämpft Naruto immernoch gegen Fuuka und scheint wieder den Kürzeren zu ziehen. Yamato hat Seito eingeholt, wird aber von Fudou wieder in einen Kampf verwickelt. Sakura wird von Fuen in einen Felsen eingesperrt, als diese Tou'u attackieren wollte. Sora gelangt zu Furiido und stellt ihn zur Rede.
Naruto und Sora trainieren, solange Sai noch verletzt ist, mit Asuma zusammen. Dieser soll ihnen weiterhin zeigen, wie man Fuuton korrekt mit Kunais anwendet, sodass sie Bäume oder sogar Felsen spalten können. Asuma hat Soras Kampfklaue zur Reparatur gegeben und diese mit einem speziellen Metall bearbeiten lassen. Es soll eine Überraschung für Sora werden. Als dieser dann durch Konoha schlendert, begegnet er Furiido, welcher ihm erzählt, dass Asuma seinen Vater getötet hat.
Danzou wird im Wald mit einem Ame-Ninja von den ANBU entdeckt und zurück nach Konohagakure gebracht, mit dem Verdacht auf Verrat. Asuma und Yamato sollen bei dem Verhör helfen. Sora schleicht sich heimlich hinterher. Es stellt sich herraus, dass der Ame-Ninja Tatsuji ein Spion Danzous und den beiden Ältesten ist. Weiterhin wird über Sora geredet. Danzou denkt daran, Sora auszulöschen, damit er keine Gefahr mehr darstellt. Das Gespräch wird unterbrochen, da Sora, der alles mitanhört, von den ANBU gefunden wird. Sora fragt anschließend, ob es war sei, dass Asuma seinen Vater tötete. Asuma bestätigt dies. Es kommt zum Kampf zwischen Asuma und Sora und plötzlich mischt sich ein Ninja vom ANBU-Kern ein und will Sora umbringen - Naruto geht dazwischen. Sora wird von Furiido entführt und soll überredet werden, sich gegen Konoha zu stellen. Am Abend sucht Naruto nach Sora und spürt etwas, aus der Richtung von Haus des Hokage. Naruto kann Tsunade vor dem Schlimmsten bewahren und folgt danach Sora, der gerade am flüchten ist.
Ganz Konoha erlebt einen Stromausfall. Nachdem Alarmstufe 2 vom Hokage ausgesprochen wurde, wird Asuma von Tsunade beauftragt, Sora sofort aufzuspüren. Nun greifen Furiido, Fuen, Fudou und Fuuka Konoha an, indem sie Kekkaimon: Gofou Jutsu: Hachimon Heijou anwenden. Bei diesesm Jutsu wird ganz Konoha von einer riesigen Mauer umgeben, die eine nach innen gebildete Abwehr-Barriere um die Stadt bildet. Sofort wird Alarmstufe 1 ausgesprochen. Die Feinde sind mittlerweile in das Dorf eingedrungen und Fudou setzt Doton: Uitenpen ein. Damit bekommt er die Kontrolle über tote Körper. Die Bewohner von Konoha werden evakuiert. Sora wird noch immer von Naruto verfolgt - Asume stößt zu den beiden. Die 4 gestohlenen Särge der Elitewächter sind am Stromgenerator von Konoha angeschlossen und sind aufgeladen.
Das Team Asuma ist zurück in Konoha. Asuma berichtet dem Hokage ihrer Mission. Gleich darauf erscheint Team Kakashi, wobei Yamato von den Erlebnissen der letzten Mission erzählt. Außerdem bittet er den Hokage, dass Sora Sais Platz im Team Kakashi einnimmt, solange dieser noch verletzt ist. Danach zeigt Naruto Sora Konoha, wobei die beiden eine Unterhaltung anfangen, in der Sora von seinem Vater erzählt. Nach dem Gespräch geht Sora alleine auf Informationssuche und versucht den Mörder seines Vaters zu finden. Naruto versucht Sora aufzuspüren und findet ihn schließlich, als er sich mit Akamaru anlegt. Nach einigen weiteren Auseinandersetzungen greifen Shikamaru und Asuma in den Kampf ein und beenden ihn. Nachdem Asuma alle zum Essen einläd, trainieren Sora und Naruto den Umgang mit den Chakraklingen. Währenddessen greifen Fuen, Fuuka, Fudou und Furiido ein Shinobi-Dorf an.
Gerade als Fuuka dabei ist, Narutos Chakra auszusaugen, kommen Sakura, Yamato und Sai. Sora hört eine Art Hilferuf und eilt ebenfalls herbei. Wie aus dem Nichts, stehen plötzlich neben ihnen Fuuka Fuen und Fudou. Sora und Naruto wollen gerade zum Kampf ansetzten, als Chiriku mit einigen Mönchen auftaucht. Fuen, Fuuka, Fudou und Furiido lassen danach vom Kampf ab und verschwinden. Wieder im Tempel, wird entschieden, dass Sora mit Naruto, Sakura, Sai und Yamato nach Konoha gehen soll.
